Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM139Q8IV31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM139Q8IV31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM139Q8IV31 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms