Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PPARGC1BQ86YN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPARGC1BQ86YN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PPARGC1BQ86YN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms