Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKAP1Q86WV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKAP1Q86WV1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms