Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP30Q70CQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms