Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF165Q6ZSG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF165Q6ZSG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms