Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DPPA3Q6W0C5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DPPA3Q6W0C5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPPA3Q6W0C5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms