Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSSK4Q6SA08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSSK4Q6SA08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms