Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT79Q5XKE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms