Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRAGBQ5VZM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms