Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf140Q5VVS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf140Q5VVS0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf140Q5VVS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf140Q5VVS0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms