Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF38BQ5VTL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms