Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC181Q5TID7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC181Q5TID7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms