Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSPH4AQ5TD94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RSPH4AQ5TD94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RSPH4AQ5TD94 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RSPH4AQ5TD94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms