Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFT2D3Q587I9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D3Q587I9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFT2D3Q587I9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms