Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A9Q2M3M2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC5A9Q2M3M2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms