Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F4Q16254 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F4Q16254 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms