Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NCOA1Q15788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA1Q15788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NCOA1Q15788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NCOA1Q15788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
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