Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTCH1Q13635 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTCH1Q13635 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTCH1Q13635 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
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