Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSRP1Q08945 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSRP1Q08945 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSRP1Q08945 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSRP1Q08945 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSRP1Q08945 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSRP1Q08945 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSRP1Q08945 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSRP1Q08945 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSRP1Q08945 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SSRP1Q08945 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSRP1Q08945 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms