Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLEQ07864 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLEQ07864 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLEQ07864 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLEQ07864 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLEQ07864 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLEQ07864 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLEQ07864 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLEQ07864 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLEQ07864 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLEQ07864 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLEQ07864 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLEQ07864 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLEQ07864 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLEQ07864 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLEQ07864 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLEQ07864 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLEQ07864 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLEQ07864 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLEQ07864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLEQ07864 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms