Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC63Q05C16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC63Q05C16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC63Q05C16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC63Q05C16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms