Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ERCC6Q03468 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ERCC6Q03468 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
ERCC6Q03468 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ERCC6Q03468 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms