Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS35P82673 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms