Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFI35P80217 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFI35P80217 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFI35P80217 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFI35P80217 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFI35P80217 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFI35P80217 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFI35P80217 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFI35P80217 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFI35P80217 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFI35P80217 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFI35P80217 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFI35P80217 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFI35P80217 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFI35P80217 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFI35P80217 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFI35P80217 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFI35P80217 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFI35P80217 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFI35P80217 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFI35P80217 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms