Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113P62684 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERVK_113P62684 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERVK_113P62684 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HERVK_113P62684 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERVK_113P62684 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERVK_113P62684 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERVK_113P62684 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HERVK_113P62684 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms