Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC1P62191 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC1P62191 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms