Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-16P61578 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-16P61578 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms