Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00310P59036 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00310P59036 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00310P59036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms