Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
WNT3AP56704 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WNT3AP56704 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms