Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
BRPF1P55201 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BRPF1P55201 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms