Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYS2P54840 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYS2P54840 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYS2P54840 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYS2P54840 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GYS2P54840 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GYS2P54840 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GYS2P54840 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GYS2P54840 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYS2P54840 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYS2P54840 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYS2P54840 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYS2P54840 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYS2P54840 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYS2P54840 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYS2P54840 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYS2P54840 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GYS2P54840 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GYS2P54840 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GYS2P54840 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GYS2P54840 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GYS2P54840 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GYS2P54840 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GYS2P54840 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYS2P54840 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms