Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP53609 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP53609 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP53609 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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