Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA2P52292 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA2P52292 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KPNA2P52292 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms