Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT3P45378 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms