Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN4P29074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN4P29074 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms