Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5A1P25705 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms