Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRBP23467 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRBP23467 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms