Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCSHP23434 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCSHP23434 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCSHP23434 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCSHP23434 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCSHP23434 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCSHP23434 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSHP23434 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSHP23434 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSHP23434 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSHP23434 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSHP23434 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSHP23434 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSHP23434 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCSHP23434 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCSHP23434 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCSHP23434 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCSHP23434 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCSHP23434 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms