Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB1P20618 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB1P20618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms