Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB4P17483 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB4P17483 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB4P17483 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB4P17483 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB4P17483 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB4P17483 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms