Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODC1P11926 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODC1P11926 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODC1P11926 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODC1P11926 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODC1P11926 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODC1P11926 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ODC1P11926 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODC1P11926 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODC1P11926 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODC1P11926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ODC1P11926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODC1P11926 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODC1P11926 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms