Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRBP10828 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRBP10828 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRBP10828 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRBP10828 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRBP10828 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRBP10828 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRBP10828 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRBP10828 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRBP10828 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRBP10828 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRBP10828 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRBP10828 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRBP10828 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THRBP10828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRBP10828 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRBP10828 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRBP10828 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRBP10828 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms