Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI3P10071 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI3P10071 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI3P10071 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI3P10071 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI3P10071 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI3P10071 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GLI3P10071 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GLI3P10071 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GLI3P10071 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GLI3P10071 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GLI3P10071 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GLI3P10071 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GLI3P10071 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GLI3P10071 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GLI3P10071 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GLI3P10071 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GLI3P10071 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GLI3P10071 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GLI3P10071 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GLI3P10071 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GLI3P10071 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GLI3P10071 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GLI3P10071 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GLI3P10071 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GLI3P10071 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
GLI3P10071 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GLI3P10071 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GLI3P10071 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GLI3P10071 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GLI3P10071 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GLI3P10071 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GLI3P10071 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GLI3P10071 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GLI3P10071 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GLI3P10071 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GLI3P10071 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GLI3P10071 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GLI3P10071 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GLI3P10071 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GLI3P10071 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GLI3P10071 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GLI3P10071 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GLI3P10071 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GLI3P10071 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms