Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2P0DI81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2P0DI81 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms