Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO3P0C6S8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO3P0C6S8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO3P0C6S8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO3P0C6S8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO3P0C6S8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO3P0C6S8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO3P0C6S8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms