Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN2P05204 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN2P05204 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN2P05204 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms