Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX6O95503 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX6O95503 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX6O95503 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX6O95503 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX6O95503 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX6O95503 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX6O95503 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX6O95503 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX6O95503 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX6O95503 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX6O95503 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX6O95503 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX6O95503 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX6O95503 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX6O95503 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX6O95503 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX6O95503 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX6O95503 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX6O95503 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX6O95503 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX6O95503 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX6O95503 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX6O95503 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX6O95503 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX6O95503 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX6O95503 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX6O95503 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX6O95503 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX6O95503 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX6O95503 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX6O95503 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX6O95503 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX6O95503 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX6O95503 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX6O95503 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX6O95503 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX6O95503 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX6O95503 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms