Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEBLO76041 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEBLO76041 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEBLO76041 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEBLO76041 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEBLO76041 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEBLO76041 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEBLO76041 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEBLO76041 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEBLO76041 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEBLO76041 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEBLO76041 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEBLO76041 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEBLO76041 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEBLO76041 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEBLO76041 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEBLO76041 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEBLO76041 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEBLO76041 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms