Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP3O75386 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP3O75386 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP3O75386 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP3O75386 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP3O75386 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP3O75386 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP3O75386 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP3O75386 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP3O75386 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP3O75386 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP3O75386 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP3O75386 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP3O75386 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TULP3O75386 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP3O75386 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP3O75386 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms