Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ATP10AO60312 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP10AO60312 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP10AO60312 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP10AO60312 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms